Bagażnik na dach - zaleta: nie potrzebujesz haka, tańszy.
wada: jak ładujesz więcej rowerów to kręgosłup dostaje "za swoje" (spróbuj przed 'wycieczką załadować na dach 4 rowery, potem na miejscu rozładować i po wycieczce jeszcze raz to samo), duże opory powietrza (1.2MPI z 4 osobami i 4 rowerami na dachu -> vmax 115 km/h wiecej nie dał rady; spalanie +2l na 100km)
Bagażnik na hak: drogi, ale wygodny, mniejsze opory powietrza; przy 3-4 rowerach trzeba uważać na dziurach (Rapid jest "nisko zawieszony, można przytrzeć o asfalt).
Ważne: trzeba sprawdzić max. nacisk na hak, wagę bagażnika i rowerów. U mnie max nacisk na kulę haka 80kg, waga bagaznika 20kg - na rowery zostaje 60 kg!
Problem z cofaniem - żaden założyłem sobie czujniki parkowania w bagażniku (na hak) :)
Z tych 2 opcji wybieram: bagażnik na hak.

Mam na dachu trzy mocowania na rower, jest to dobre rozwiązanie ale hak ma więcej zalet. Z tym mocowaniem na dach mam THULE i nie każda rama pasuje do niego. Zapinałem w  wakacje Embassa który ma nietypową ramę, i podczas zjazdu z średnio wysokiego bagażnika, mocowanie wspornika się poluzowało i rower wylodował na dachu, gniotąc go. 
Droższy będzie jak ale jeśli masz często przewozić rower to idź w to droższe.